Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms