Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms