Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms