Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms