Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms