Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms