Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms