Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms