Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms