Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms