Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gapvd1Q6PAR5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms