Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Lce3fQ6PAI4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms