Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl2Q6PA06 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms