Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms