Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms