Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms