Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd11Q6NS46 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms