Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms