Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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