Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Tpm4Q6IRU2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Tpm4Q6IRU2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms