Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11bQ6DFW5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms