Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms