Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Usp7Q6A4J8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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