Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms