Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc2Q69ZB8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc2Q69ZB8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms