Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk13Q69ZA1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms