Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf280dQ68FE8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms