Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms