Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VclQ64727 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VclQ64727 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VclQ64727 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VclQ64727 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VclQ64727 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VclQ64727 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VclQ64727 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VclQ64727 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VclQ64727 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VclQ64727 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VclQ64727 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VclQ64727 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms