Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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PtprcapQ64697 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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PtprcapQ64697 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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PtprcapQ64697 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PtprcapQ64697 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PtprcapQ64697 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PtprcapQ64697 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PtprcapQ64697 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PtprcapQ64697 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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PtprcapQ64697 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprcapQ64697 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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