Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt12Q64291 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt12Q64291 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms