Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms