Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga3Q62470 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms