Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm20854Q62461 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm20854Q62461 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm20854Q62461 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm20854Q62461 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm20854Q62461 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm20854Q62461 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm20854Q62461 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20854Q62461 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20854Q62461 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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