Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SpegQ62407 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SpegQ62407 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SpegQ62407 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SpegQ62407 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SpegQ62407 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SpegQ62407 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpegQ62407 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SpegQ62407 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SpegQ62407 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SpegQ62407 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpegQ62407 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SpegQ62407 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SpegQ62407 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SpegQ62407 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpegQ62407 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpegQ62407 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms