Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SypQ62277 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SypQ62277 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SypQ62277 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms