Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms