Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms