Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms