Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms