Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcanQ62059 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcanQ62059 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcanQ62059 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms