Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PtafrQ62035 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PtafrQ62035 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PtafrQ62035 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PtafrQ62035 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtafrQ62035 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtafrQ62035 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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