Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga6Q61739 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms