Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga7Q61738 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga7Q61738 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms