Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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