Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcd1Q61466 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms