Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms