Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms