Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms