Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms